Aufgrund der geplanten Realisierung eines Neubaus an gleicher Stelle können auf dem Spitalgelände während der Übergangszeit keine Leistungen angeboten werden. Das Kantonsspital St.Gallen wird jedoch ein ambulantes Grundangebot in den Räumlichkeiten des Ärztezentrums Flawil an der Magdenauerstrasse 1 – unter dem Namen «Ambi Flawil» – weiterführen. Das Übergangsangebot umfasst Sprechstunden in den Bereichen Orthopädie, Allgemein- und Viszeralchirurgie sowie Urologie.
Die Notfallversorgung in der Region bleibt ebenfalls weiterhin gewährleistet. Sie wird von den Ärzten des Hausarztvereins Flawil-Degersheim sichergestellt, die neu Dienst auf der interdisziplinären Notfallstation (INP) des Spitals Wil leisten.
Deshalb gilt seit 1. Juni 2021 neu folgende Notfallnummer: 071 914 61 11 (während 24 Stunden, 365 Tage im Jahr).